江中网讯（通讯员 古丽米热·图尔贡）4月23日，江西中医药大学刘红宁教授、曾治君教授团队在Nature子刊、国际知名科学数据开放共享期刊《Scientific Data》发表题为“Three Near telomere-to-telomere Genomes for Gardenia jasminoides”的论文（Article in Press），首次构建了三套栀子（Gardenia jasminoides）端粒到端粒（T2T）级高质量基因组。

栀子为茜草科栀子成熟果实，既是经典本草中的清热泻火、凉血解毒要药，又广泛用于食品着色、调味和日常调养，是国家药食同源物质目录及江西省药食同源目录中的优势品种之一。江西吉水、新干等地栀子资源独具特色，是江西中医药“道地药材和药食同源产业”发展的重要支点。

自2023年起，曾治君教授带领课题组先后在福建及江西省内多个栀子产区，收集了3个不同的栀子栽培类型，2025 年正式启动基因组“解码”，历经3年全基因组测序，成功破译栀子端粒到端粒级别高质量基因组。本次研究以江西吉水药用品系、福建福鼎药用品系和江西新干色素与食品用品系为代表，综合采用Oxford Nanopore 超长、PacBio HiFi高保真长读长和Hi-C三维基因组技术，高质量组装出覆盖全部11条染色体、端粒到端粒的三套参考基因组，BUSCO完整度均超过98%，注释到功能的蛋白编码基因均逾3.4万个，为后续功能基因和代谢通路解析奠定了坚实基础。

研究进一步通过全基因组比对系统解析三套基因组间的大量结构变异，发现药用品系与色素或食品用品系在环烯醚萜苷、类藏红花苷等次生代谢路径相关基因上存在显著差异，为从“基因组结构、活性成分、中医药功效”角度理解栀子“苦寒清火、色黄入脾、药食两宜”的传统认识提供了关键线索，也为栀子分子育种、质量评价与标准化栽培提供了可直接利用的分子标记资源。

作为药食同源物种，栀子在新食品原料、健康产品和中药创新中具有巨大潜力。本研究开放共享的T2T栀子基因组，将成为全球栀子及其近缘植物多组学研究的重要基因组基础。该成果可大幅提升优良品系选育效率，服务江西乃至全国栀子产业的标准化、品牌化和国际化发展，助力中医药更好融入“健康中国”和“一带一路”大格局。

本次论文第一作者为曾治君教授，通讯作者为刘红宁教授。两位学者长期扎根中医药原创创新一线，围绕药食同源、中药药性与多组学交叉开展系统性布局。本次栀子T2T基因组工作的完成，是团队在中医药“原始创新能力”和“重大关键技术”攻关上的重要里程碑，也为后续围绕栀子开展新功效发现和产品转化等一系列工作预置了战略高地。

稿件来源：中医基础理论分化发展研究中心

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