中医基础理论分化发展研究中心现已形成6个研究平台，包括代谢组学与药代动力学、小动物行为学、动态可视化、生理生化、分子生物学、细胞生物学等研究平台。目前，购置仪器设备价值近3000万，共计350余台（套）。各平台现有大型仪器设备如下：
代谢组学与药代动力学研究平台
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高分辨质谱仪Waters/SYNAPT G2-S主要用于分子式测定和分子结构鉴定（如化学合成产品，天然产物，代谢物，残留农药，配位化合物等）；大分子研究（如：蛋白质/多肽，多糖，多聚物等）；复杂混合物分析。 
超高压液相色谱/四极杆-飞行时间串联质谱仪Agilent 6538 QTOF/1290UHPLC 主要用于物质分析。 |
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三重四极杆液质联用仪 TripleQuad5500主要用于复杂基质中化合物定量分析。 |
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超速离心机Optima MAX-XP贝克曼库尔特主要用于样品处理。 |
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超高效液相色谱仪Waters/UPLC H-CLASS主要用于含量测定、快速分离 |
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高效液相色谱仪Agilent 1260 主要用于药物分析 |
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电动旋转蒸发仪系统butch R-210主要用于样品浓缩 |
小动物行为学研究平台
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小动物行为记录视频分析系统SMART 配有旷场，跳台，轮转疲劳仪，强迫游泳，和水迷宫，主要进行情志致病相关性研究，水迷宫进行衰老以及脑学习记忆机制相关的研究。采用小动物行为视频分析软件进行分析。 
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检疫隔离笼EVC 实验动物饲养 动物安全柜ESCO VDA-4A1动物实验安全操作 
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动态可视化研究平台
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正置微循环观察系统Geneandi-M 与倒置微循环观察系统Geneandi-M2 用于活体情况下无创伤地观察到人体表层或实验动物实体器官等厚的不透光的生物组织内的毛细血管管壁中内皮细胞和基底膜等组织结构形态变化，并自动识别血管边界分析血流速度、血管直径等参数。 
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生理生化研究平台
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多通道电生理数据采集分析系统澳大利亚 ADI/PL3516/P主要用于计算和分析各种生命科学相关信号（包含心电、新陈代谢、血压、神经放电直方图、心率变异性、心输出量等） 
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微透析采血系统CMA4004主要用于生物样本采样。 
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全自动生化分析仪（原装进口）贝克曼库尔特AU480 主要用于检测、分析生命化学物质。 
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无创血压测量系统（进口产品）BP-2000主要用于无创检测大小鼠血压。 
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分子生物学研究平台
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微滴式数字PCR系统BIO-RAD,QX200主要用于对靶 DNA 或 RNA 分子进行绝对定量分析，基因表达（极低量），稀有碱基突变，单拷贝数分析。 
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实时荧光定量PCR仪ABI 7500用于基因表达分析，病原体绝对定量分析，SNP基因型分析以及以阳性内对照为基础的阳性/阴性结果判定。 
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脉冲场电泳BIO-RAD.CHEF Mapper XA 主要用于基因组DNA的分离分析，大分子DNA的指纹图谱分析及多态性分析等。 
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通用突变检测系统BIO-RAD, Dcode主要用于在癌症及由单基因或多基因引起疾病的研究中，未知位点突变；根据DNA多态性，应用于物种鉴定、种群结构分析及遗传多样性等研究领域。 
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全波长酶标仪美国MD SpectraMaxPlus384主要用于结果检测、细胞增殖毒理分析、DNA/RNA/蛋白质定量与纯度分析。 
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细胞生物学平台
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超速流式细胞分选系统贝克曼库尔特MoFlo XDP主要用于细胞表型分析、DNA倍体及细胞周期、细胞凋亡分析、基于细胞内外蛋白的分析及分选。 
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蛋白质-细胞相互作用实时分析系统Ridgeview /Ligandtracer Green主要用于蛋白质与细胞相互作用实时观察分析 
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倒置荧光显微镜系统OLYMPUS IX71OLYMPUS主要用于细胞形态分析。 
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